NEJM:下一代测序14岁免疫缺陷综合征少年生命

  导读:除了我们平时所熟悉的无创产前胎儿DNA检测,近日下一代测序在临床上又取得了重要突破:美国大学分校的研究人员通过下一代测序成功确诊并了一位14岁入院六周一度陷入药物引起的昏迷状态,并患有联合免疫缺陷综合征少年的生命。

  美国大学分校的研究人员近日使用新一代基因测序技术,成功确诊并了一位14岁患有联合免疫缺陷综合征少年的生命。研究刊登于6月4日的影响因子高达51.658的《新英格兰医学期刊》(The New England Journal of Medicine)。研究人员表示,该项技术并没有人们想象中那么遥远,以后所有感染病菌的患者都可通过这项技术获得明确诊断,基因测序将是未来大趋势。

  患者在长达4个月的时间内一直出现发热和头疼症状,病情一直没有得到有效控制,最后发展为脑积水和癫痫状态。医院使用各种诊疗手段都没有起到作用。最后医生通过对脑脊髓液进行基因测序,诊断出该患者在脊髓液中有钩端螺旋体病菌,并用最普通的盘尼西林将该患者治愈。

  根据大学分校(UCSF)医学实验室的华裔教授Charles Chiu介绍,在对脑脊髓液和血液进行分析仅仅48小时后,该男孩就得到了快速的诊断和成功治疗。

  这预示着“下一代测序(NGS)”技术将在解开传染病谜团中的具有更广泛应用:不仅可用于前沿的研究机构,而且可用于随处可见的、医生可以接近的临床实验室。

  采用NGS技术大大缩短了样品采集和可行诊断之间所需的时间,帮助威斯康星大学的一个医疗小组了年轻患者的生命。

  这项研究将实时DNA测序、庞大的基因组数据库(用于识别病原体和其他生物体)和先进的计算分析工具(快速分析数百万个数据点)融合起来,不仅可以同时识别患者样本中的所有DNA,而且无需培养或靶定特定的传染病原体。

  从成本和周转时间的角度来看,这是一项非常强大的技术,已成为切实可用的临床实验室常规实施技术。”

  目前,一些临床实验室可提供NGS检测,以确定临床试验中的癌症突变,并确定出生缺陷相关的突变。

  然而诸如脑膜炎和肺炎的疾病一直困扰着医学界。现在有超过半数的脑膜炎和30%的肺炎疾病都仍然属于医学空白领域,无法进行明确诊断。

  基因测序产业链,上游为测序仪器和试剂供应商,中间为基因检测服务提供商,下游对象为医院,药企,科研机构和病人。

  在美国,大约有2万人(主要是儿童),每年因脑肿胀脑炎入院,有4000多人因脑膜炎入院。在几乎一半的脑炎病例中,并没有发现病因,然而,本案例指出,如果不能将传染与自身免疫区分开来,可能会引起更严重的病情。

  在国内,从事临床测序的企业有华大基因和贝瑞和康,前者收购美国著名测序公司CG公司,产品正在寻求国内审批,而后者于全球测序巨鳄Illumina联手生产测序仪。

  然而早在2004年已经在A股上市的达安基因(002030.SH)目前呈现后来居上的趋势,公司与Lifetech合作的IonProton测序平台DA8600已经申请报证审批。

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