【声音】石乐明:基因测序临床挑战,缺乏标准化

  在人们纷纷为基因测序的迅猛进展而欣喜若狂,急切地希望临床普遍应用的时候,我们更应该冷静谨慎,重视来自临床的声音,才能真正把基因测序用对,用好。

  复旦大学医学院教授石乐明在2014新一代测序论坛上表示,目前基因测序应用于临床存在挑战,主要表现在,数据获取的平台和后期的数据处理都没有标准化的质量控制。“同一个标准样本,用不同测序平台的测试结果不同,影响临床决策。”

  石乐明指出,除测序平台差异外,基因样本的取样和保存同样影响测试结果差异。而在后期的数据分析上,不同的团队基于同样数据分析出的结果也不同。“缺乏标准化的质量控制,数据本身不可靠,分析方法也不可靠。”他强调,基因测序此前大多用于科研,测序的结果偏差并不影响学术研究。但应用于临床,丝毫偏差都会影响临床决策。

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