福利贴 Illumina测序方法汇总

  在高通量测序中,Illumina的测序仪一直是重要的工具。然而,人们渐渐发现,标准的操作步骤已不能满足他们的特定需求。于是,研究人员不断开发出新的NGS样品制备方法,以解决新的挑战。为此,Illumina编辑了一份小,收录了近年来发表的各种Illumina测序应用。

  在高通量测序中,Illumina的测序仪一直是重要的工具。然而,人们渐渐发现,标准的操作步骤已不能满足他们的特定需求。于是,研究人员不断开发出新的NGS样品制备方法,以解决新的挑战。不过,这些方法如此之多,名字又有些相似,让人很难记住。下次想起再去找的时候,又无从下手了。

  为此,Illumina编辑了一份小,收录了近年来发表的各种Illumina测序应用。这份名为《测序方法回顾》(Sequencing Methods review)的小覆盖了Illumina边合成边测序技术能解决的各种问题。它以免费的PDF格式提供,简要介绍了每种方法,当然,这些方法是由用户开发的,因此读者需要参考原始文献,才能了解详细的介绍和操作。

  对于这些目录中的每种Illumina测序分析,该文档列出了文库制备方法,所使用的Illumina技术,优点与缺点,简短总结及相关文献。这也不是Illumina第一次整理这些。之前Illumina还设计了一份类似的海报,内容很好,图形并茂,但不适合在电脑上看。如果有一张,贴在墙上,倒是个不错的选择。

  举个例子,小中介绍了哈佛大学谢晓亮教授开发的MALBAC技术。这种技术克服了MDA(多重置换扩增)的缺点,适用于单细胞测序或起始材料极其有限的样品测序。整个扩增子成环防止DNA多次拷贝,减少PCR偏向。这种技术能扩增富含GC的区域,实现均匀的基因组覆盖。不过,与Phi 29相比,聚合酶容易产生错误,且操作对温度。

  对于大家常用的BS-Seq、ChIP-Seq、RIP-Seq方法,小中都有详细介绍。如果不幸没有你想要了解的方法,可以联系Illumina。这份小应该也有印刷版,可以向Illumina。

  之前,Illumina也发布了各个应用的论文回顾,包括肿瘤学、传染病、宏基因组学等等,有中文版和英文版。有兴趣的同学也可向Illumina。希望这些方法能激励大家开发出新的方法哦。小编只能帮你到这里了。

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