固相pH梯度可窄至pH0.1的范围,因此分辨率极高,可达0.001pH;pH梯度稳定,不漂移;灵活性大,可随意选择pH梯度和斜率;重复性好;加样容量大;样品中盐的干扰小;对碱性蛋白质也能很好的分离,缘效应,故可用很窄的胶条(如5mm宽)聚焦,特别适合于双向电泳的第一相,但固相 pH梯度灌胶技术复杂,只能使用聚丙烯酰胺凝胶,电泳时候需要高电压,电泳时间长,窄范围pH测定困难,只能计算.
固相pH梯度分辨率高,故使用预窄pH范围的分离,对未知样品,应先用宽pH范围的载体两性电解质聚焦大致确定其等电点,再用固相pH梯度凝胶精确分离,对复杂成分样品和双向电泳的第一相,应采用宽范围的固相pH梯度凝胶.
固相pH梯度等电聚焦时,样品的处理方法同载体两性电解质等电聚焦方法大致相同,甚至要求比后者还低,但是一些蛋白质的可溶性很低,或在接近等电点时可溶性很低,此时必须使用增加可溶性的添加剂,如载体两性电解质、尿素、去垢剂等提高分离效果.膜蛋白等电聚焦时,样品和凝胶中加入载体两性电解质可增加膜蛋白的可溶性.
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