片段的回收技术是重组DNA中的关键技术，回收是指从电泳介质中纯化出目的片断。目前待回收的片断主要有酶切片断和各种PCR片断；回收的介质主要有琼脂糖和PAGE；回收的方法主要有树脂回收、微量柱回收、玻璃奶回收、液氮冻冻融回收及透析袋大量回收等，下面分别介绍树脂、微量柱及液氮冻冻融回收技术。树脂回收特别适合于PCR片段的回收，具有纯度高、操作简洁等特点，经此方法回收的片段可有效的用于重组载体构建。通过15分钟的纯化过程，PCR产物即能被有效地从含二聚体、非性扩增引物片断等混合物中分离出来，成为高度无盐的、不含其他大成分的纯化片断。在较宽的量范围内有较高的回收效率。下表为不同长度的DNA片断，在室温条件下，用此纯化系统直接纯化时，各自相应的回收率。1) 用低熔点或常规熔点琼脂糖电泳对PCR扩增片断进行分离，该电泳安常规方法进行，缓冲液为TAE.2) 在凝胶上，找到所需条带，然后用洁净并灭菌的小刀将其切下接近300微升琼脂糖凝胶 (约300毫克)A. 将300微升琼脂块放进1.5毫升的微量离心管中，加入1毫升纯化用树脂，然后将其置于65℃水浴保温5分钟，或保温至琼脂完全溶解。B. 将300微升琼脂块放进1.5毫升的微量离心管中，然后将其置于70℃水浴保温至琼脂完全溶解，然后加入1毫升纯化用树脂到融化好的琼脂中，将其混合20秒，但不要振动。4) 为每一个待回收片断准备好一个微量柱. 在每个柱的开口处，联上一针筒，然后将这些柱与针筒的复合体与抽线) 在柱-针筒复合体中加入树脂/DNA混合物，打开真空装置，将树脂与DNA的混合物抽到 微量柱中，断开线) 继续线秒以干燥树脂，注意此干燥时间不能超过30秒。关闭真空，移去针筒。将微量柱转移至一1.5毫升微量离心管中。10000g离心2分钟，以彻底除去的异丙醇。8) 将微量柱，再转移至一新的1.5毫升微量离心管中，加入50微升水或TE缓冲液，静置1分钟(在头30秒，DNA仍将吸附于柱上)，10000g离心20秒，以洗脱DNA片断，所得纯化后的DNA片断可直接用于连接反应或在-20℃保存。
1. 对于>3Kb的片断在纯化回收时，洗脱前，如先将水或TE缓冲液预热到65-80℃，则将能有效的提高回收率。待洗脱片断>3Kb时，洗脱液温度应为65-80℃;待洗脱片断>20Kb时，洗脱液温度应达80℃。2. 应用TAE缓冲液，而不应用含TBE的胶，因硼酸能与琼脂糖中的方式糖单体或多聚体结合成难溶复合物，这种复合物使胶难熔解。3. 在取用纯化柱树脂中的液体前，应将树脂充分搅匀，如树脂中出现结晶或结块，则应将树脂在25-37℃，温热10分钟，冷却至30℃使用。树脂本身不会溶。4. 在紫外光下观察切割条带时，操作要快，DNA条带在紫外光下的时间应尽量短，因UV会引起DNA变异。
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