为什么说lncRNA越来越难做，一方面是机制研究要求高了，另一方面lncRNA研究工具也在不断升级。
nanoCAGE、MERFISH、SHAPE、PAR-CLIP是什么鬼？最近师兄打算尝试一下，就看老板愿不愿意割肉了！
2017年lncRNA相关的基金项目为421个，总资助金额为1.77亿，明年的国自然就得从现在马上准备了。
技术，不管新老，必定是基于lncRNA的作用模式，都知道lncRNA可在水平、后水平、翻译后水平参与调控，具体的可阅读：国科金写作，lncRNA的机制该怎么设计？
没钱做测序或者芯片？没关系，可以靠数据库来完成，利用GEO和TCGA的测序和芯片数据，找到差异的lncRNA。
研究lncRNA时首先要能试验（过表达和敲减），然后是细胞定位（locallization），然后根据预测的作用模式，开展实验，例如与RBP结合等。
最火的基因编辑技术，问题是删除了lncRNA的基因，也会影响相同的其他本表达，这就比较棘手了。
一个替换的模式是用dCas9，将不具有核酸剪切活性dCas9(deadCas9)与负责激活、、表观调控和荧光表达等蛋白相融合，可以实现对靶基因的水平及表观遗传的调控
FISH只能定性，而定量版本就是smFISH，它是一种新的基因定量分析方法，能报告本丰度和空间定位。
MERFISH是一个高度多重化的smFISH成像方法，可以在单个细胞中鉴定数千种RNA的拷贝数和空间定位，可谓高逼格的FISH技术。
这种技术实现高通量的lncRNA表达分析以及起点的图谱分析，2011年由日本科学家发明。
其依赖了具有光活性的核糖核苷类似物，例如4-硫尿核苷，在活体细胞中将其插入到新生RNA本中。在365nm紫外灯辐射的细胞中，光活性的核糖核标记的RNA被与RBP相互作用。RNA随即被转换成cDNA文库并且进行深入测序。
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