1、近交品系豚鼠目前世界上有12个.由于豚鼠妊娠期较长为68(62～72)天,一胎生得少,一般2～3只,培育一个近交品系需要20～30年,所以近交品系较少.用于医学科研的近交品系纯系2号和纯系13号.
(1)近交系2：此品系1906年引自美国农业部,在1951年11代时,Wright采用兄妹交配繁殖到1933年的33代后,改为随机交配,一直到1940年.1940年Heston继续采用兄弟交配.1950年引入美国国立卫生研究院(NIH),并分布于世界,其毛色为三色(黑、红、白),大部分在头部,其体重小于13系,但脾脏、肾脏和肾上腺大于13系,老龄豚鼠的胃大弯、直肠、肾脏、腹壁横纹肌、肺脏和主动脉等部都有钙质沉着,对结核杆菌抵抗力强,并具有纯合的GPL-AB.I(豚鼠主要组织相容性复合体)抗原,血清中缺乏诱发迟发超敏反应的因子,而对实验诱发自身免疫性甲状腺炎却比13系.
(2)近交系13：其毛色也有三色(黑、白、红),大部分在头部,其育成历史与2系相同,所有的亚系都是从美国NIH输出的,这个品系对结核杆菌抵抗力强,性活动比2系差,体形较大,GPL-AB.1抗原与2系相同,而主要组织相容性复合体1区与2系不同,对诱发自身免疫性甲状腺炎的抵抗力比2系和 Hartley远交群强,期一年的豚鼠其白血病自发率为7%,流产率为21%,死胎为45%, 血清中缺乏诱发迟发超敏反应的因子.在已有的30多种远交群豚鼠中,使用最广泛的是Hartley品系1,它是1926年Dunkin-Hartley用英国种豚鼠繁育而成.
我国1973年曾从英国实验动物中心引进DHP远交群豚鼠,也是属于Dunkin-Hartley品系,由于饲养在Pirbright单位,而被称为DHP,引进我国后经过8代兄妹交配繁殖,又改用随机交配到现在,目前对其特性还不清楚,尚未推广使用.
(2)安哥拉种：毛细而长,能把脸部、头部、身体覆盖住.对寒冷和潮湿特别,不易饲养繁殖,雌鼠一般一胎只生一只仔鼠,而且仔鼠成活率较低.这种豚鼠不适于做实验.
(4)阿比西尼亚种：短毛,但毛长成后似蔷薇花状的卷涡毛.这种豚鼠极易感染各种疾病,因而亦不适于用作试验.
目前我国各研究教学单位使用的豚鼠多为短毛的英国种豚鼠.不同毛色的英国种豚鼠杂交可形成不同的变种,如纯白色、黑色、棕色等,因此这些非纯种短毛豚鼠,被毛颜色是多样的,但基本是棕黄、黑、白三种颜色,可以棕黄、黑、白相同,形成不规则的斑点,称三色豚鼠,也可有二色或单色豚鼠.安哥拉种、秘鲁种、阿比西尼亚种豚鼠抵抗力较差,很容易感染疾病,均不适宜作试验,都用来作观赏动物.
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